早稻田设有大学本科和研究生院。大学本科包括政治经济学、法学、第一文学（包括哲学、史学、文学等18个专业）、第二文学（包括社会学、外语、戏剧、文艺等8个专业）、教育、商学、理工、社会科学等8个学部。研究生院有政治学、经济学、法学、文学、商学、理工学等6个研究科。附设图书馆、戏剧博物馆、产业经营研究所、比较法学研究所、系统科学研究所、铸物研究所、大学史编纂所、环境保护研究中心、电子计算机研究室等机构。另有高等学院、专门学校、实业学校、高中和初中等